Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msl3Q9WVG9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msl3Q9WVG9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms