Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx1Q9WV80 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx1Q9WV80 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms