Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapaQ9WV55 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms