Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec2Q9WV35 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms