Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabbr1Q9WV18 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabbr1Q9WV18 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabbr1Q9WV18 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabbr1Q9WV18 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms