Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms