Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lemd3Q9WU40 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lemd3Q9WU40 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lemd3Q9WU40 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms