Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim3Q9R1R2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim3Q9R1R2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms