Protein–RNA interactions for Protein: Q9R112

Sqor, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqorQ9R112 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SqorQ9R112 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SqorQ9R112 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms