Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt6Q9R0N8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt6Q9R0N8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms