Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M6

Rab9a, Ras-related protein Rab-9A, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab9aQ9R0M6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab9aQ9R0M6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab9aQ9R0M6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab9aQ9R0M6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab9aQ9R0M6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab9aQ9R0M6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab9aQ9R0M6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab9aQ9R0M6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Rab9aQ9R0M6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab9aQ9R0M6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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