Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek3Q9R0A5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek3Q9R0A5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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