Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsjQ9R014 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms