Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp21Q9QZL6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms