Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copg1Q9QZE5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copg1Q9QZE5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms