Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt3Q9QZ47 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms