Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exo1Q9QZ11 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms