Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmeff2Q9QYM9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff2Q9QYM9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms