Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic4Q9QYB1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clic4Q9QYB1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms