Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Irx4Q9QY61 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms