Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx8Q9QXV1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms