Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PolkQ9QUG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PolkQ9QUG2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms