Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms