Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms