Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrfQ9JM73 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrfQ9JM73 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms