Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep6Q9JM62 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms