Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd2apQ9JLQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd2apQ9JLQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd2apQ9JLQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms