Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms