Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgm1Q9JLF6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm1Q9JLF6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms