Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SacsQ9JLC8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SacsQ9JLC8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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