Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtrQ9JKK8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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AtrQ9JKK8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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AtrQ9JKK8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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AtrQ9JKK8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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AtrQ9JKK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtrQ9JKK8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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