Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl39Q9JKF7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms