Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms