Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4m1Q9JKC7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4m1Q9JKC7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms