Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ybx3Q9JKB3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ybx3Q9JKB3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ybx3Q9JKB3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms