Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2j1Q9JJZ4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2j1Q9JJZ4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms