Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx20Q9JJY4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms