Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms