Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FliiQ9JJ28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FliiQ9JJ28 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms