Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smad9Q9JIW5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms