Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb1Q9JIF7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms