Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms