Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htr3bQ9JHJ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3bQ9JHJ5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms