Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LrbaQ9ESE1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LrbaQ9ESE1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LrbaQ9ESE1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms