Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3bQ9ES34 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms