Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrnb2Q9ERK7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms