Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cse1lQ9ERK4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms