Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfip11Q9ERA6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfip11Q9ERA6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfip11Q9ERA6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms