Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r44Q9EQ47 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r44Q9EQ47 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r44Q9EQ47 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r44Q9EQ47 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r44Q9EQ47 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r44Q9EQ47 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r44Q9EQ47 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms