Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Mmp1aQ9EPL5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp1aQ9EPL5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms